作為信息技術(shù)領(lǐng)域的國立科研機(jī)構(gòu)，計(jì)算所非常重視知識產(chǎn)權(quán)的保護(hù)和運(yùn)用，做好高價(jià)值專利的挖掘和布局，積極探索拍賣、轉(zhuǎn)讓、許可等多種轉(zhuǎn)移轉(zhuǎn)化方式，近十年授權(quán)專利轉(zhuǎn)化率達(dá)到40%。
知識產(chǎn)權(quán)獎(jiǎng)項(xiàng)方面，2010年至今獲得12項(xiàng)中國專利獎(jiǎng)和北京市發(fā)明專利獎(jiǎng)。其中2018年，計(jì)算所作為專利權(quán)人在高性能計(jì)算方向的發(fā)明專利“ZL201010267931.X一種多處理器系統(tǒng)及其同步引擎”憑借其先進(jìn)的技術(shù)優(yōu)勢、顯著的經(jīng)濟(jì)與社會效益從眾多參選專利中脫穎而出，獲第二十屆中國專利金獎(jiǎng)。
知識產(chǎn)權(quán)工作獲得多方認(rèn)可，2007年成為北京市專利示范單位，2009年成為國家首批專利示范單位，2017成為北京市知識產(chǎn)權(quán)運(yùn)營試點(diǎn)單位，2019年成為北京市知識產(chǎn)權(quán)運(yùn)營示范單位。
2019年4月，計(jì)算所作為中科院弘光專項(xiàng)承擔(dān)單位，全面啟動《科研組織知識產(chǎn)權(quán)管理規(guī)范》貫徹工作。采用職能部門全覆蓋，主要科研單元選擇覆蓋的方式開展貫標(biāo)認(rèn)證工作，目前正處于體系試運(yùn)行階段，預(yù)計(jì)2020年通過第三方認(rèn)證。
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